Depuis 2010, le CIFDHA organise, en partenariat avec le CODAP, une session annuelle de formation régionale dénommée "universités d'été des droits humains" (UEDH). Cette formation de référence pour les jeunes défenseurs africains réunit au Burkina Faso une trentaine de jeunes venant d'une dizaine de pays africains pour le renforcement de leurs capacités en droit international des droits de l'homme, en stratégie d'actions et sur une thématique spécifique. Les thématiques passées sont:
2010: Migrations et droits humains
2011: Impunité et justice pénale internationale
2012: La responsabilité sociale des entreprises (RSE) en Afrique : quels enjeux en matière de droits humains
2013: Médias sociaux, droits humains et démocratie
2014: Droits humains et accès à la justice
2015 : Gouvernance du secteur de la sécurité : rôle des acteurs pour une meilleure garantie des droits humains
En dehors de UEDH, le CIFDHA organise des sessions de formation et d'éducation aux droits humains (EDH) au profit des élèves et étudiants, des leaders d'opinion, chefs traditionnels et religieux, des professionnels (journalistes, magistrats, avocats, parlementaires, etc.). Les actions de plaidoyer comme celui en faveur de l'abolition de la peine de mort s'appuient toujours sur des formations préalables au profit des acteurs cibles.