Le CIFDHA mène des actions de plaidoyer pour l'amélioration de la situation des droits humains et sur différentes thématiques, seul ou en partenariat avec d'autres organisations locales. En 2015 le CIFDHA a pris part au plaidoyer sur la santé sexuelle et reproductive d'Amnesty International Burkina Faso. La même année, le CIFDHA, dans le cadre du processus électoral le CIFDHA a engagé avec les            organisations de jeunesse partenaires du NDI un plaidoyer en faveur de la prise en compte des préoccupations des jeunes, dont la lutte contre mortalité maternelle et infantile. Au cours de 2016 le CIFDHA a engagé un plaidoyer en faveur de l'abolition de la peine de mort avec les autres organisations membres de la Coalition nationale contre la peine de mort au Burkina Faso et le soutient de l'OIF. Dans le cadre de la mise en œuvre des recommandations du Comité des droits de l'homme de l'ONU, le CIFDHA a engagé en 2017 un plaidoyer à l'endroit du gouvernement pour          l'éradication des pratiques traditionnelles néfastes à l'égard des femmes.